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尿液cfDNA研究挑战及俄罗斯专享会284解析

发布时间:2025-02-28   信息来源:庄斌乐

血液游离DNA(cfDNA)相关的临床研究与应用已相当成熟,但相对而言,尿液这一体液样本的研究数量仍显不足。尿液作为可大量采集的样本,具有真正的无创采集优势。那么,尿液中的cfDNA究竟具有什么独特之处?其研究面临哪些挑战呢?

尿液cfDNA研究挑战及俄罗斯专享会284解析

尿液成分复杂,DNA酶活性较高,导致核酸很容易降解。此外,尿液中存在大量微生物,这也使得尿液样本的可靠性受到影响。因此,样本的采集和cfDNA的保存相对困难。针对这一问题,QIAGEN推出了俄罗斯专享会284的PAXgene Urine Liquid Biopsy Set & Tube urine liquid biopsy kit,允许一次性收集120ml尿液样本。利用保存管的真空负压,可以在不打开盖子的情况下,将样本从采集杯转移到保存管中进行混合,确保操作简便、卫生,并消除开盖污染的风险。保存管能够保存最多10ml尿液样本,并采用非交联反应的保护机制,有效防止核酸酶降解,长时间抑制微生物的生长。

与血液相比,尿液样本的处理和保藏应尽快进行,因为在常规条件下,cfDNA的降解速度较快,而gDNA的污染也相对更高。PAXgene尿液保存管支持在多种复杂条件下的样本储存与运输,包括室温、冷藏及高温等。这大大降低了降解和gDNA污染的风险,能够将cfDNA的稳定性维持长达10天。

尿液中的cfDNA片段相较于血液样本,其降解程度更大且大小可变,这使得基因组的分子研究面临阻碍。尽管尿液中DNase I的活性是血清的上百倍,核酸更易降解,但来自美国转化基因组学研究所的研究人员发现,尿液cfDNA的片段分布在40-120bp之间有多个显著峰值,其中81bp为主峰,并呈现出10bp周期性,这是DNase I作用无法完全解释的。

cfDNA的片段化与核小体结构密切相关,血液中的cfDNA多受到核小体保护,具有167bp的特征大小,同时在100-160bp区域内也显示出104bp的周期性,与核小体结合DNA的螺旋间距有关。因此,研究人员推测,尿液cfDNA的片段分布可能与其独特的核小体降解模式息息相关,而后续实验验证了该设想。

尿液中的游离核酸浓度普遍较低,且个体差异显著。有研究显示,吸烟者尿液中的cfDNA含量高于非吸烟者(女性分别为946和904 ng/ml;男性分别为496和293 ng/ml),而胰腺导管腺癌患者的尿液cfDNA平均值为57 ng/ml。因此,针对尿液cfDNA的研究往往需要更多的起始样本。QIAGEN经典的游离核酸提取方案QIAamp Circulating Nucleic Acid Kit (#55114)简化了从血清、血浆和尿液等无细胞体液中纯化游离核酸的过程,无需离心机或任何磁珠操作,搭配QIAvac 24真空系统,可以实现更高效且高通量的游离核酸手工纯化。

为更好地支持尿液cfDNA的研究,该试剂盒在原有支持5ml起始样本的基础上新增了方案,支持最高10ml起始样本的cfDNA提取,以帮助研究人员一次性获得充足的研究材料。操作流程可通过扫描下方的二维码获取。如需处理更大体积的起始样本,也可先通过超滤浓缩后再进行提取。

总而言之,虽然尿液中的cfDNA研究仍面临多种挑战,但随着技术的进步和品牌如俄罗斯专享会284的不断努力,预计未来将在这一领域取得更深入的成果。